Le génie maléfique Plankton a créé une armée de zombies qui ont envahi la ville de Bottom City. Dans le jeu Bob's Neighbor vs Zombie, vous devrez aider Bob l'éponge à combattre ses hordes de zombies. Devant vous sur l'écran sera visible votre personnage, qui se trouvera dans l'une des rues de la ville. Il aura une arme entre ses mains. Votre personnage avancera le long de la rue de la ville. Sa tâche est de sauver les habitants de la ville. Les morts-vivants l'attaqueront constamment. Vous contrôlez le personnage devra le forcer à mener des tirs bien ciblés sur les zombies. Essayez de tirer avec précision dans la tête pour tuer les zombies du premier coup. À leur mort, les zombies peuvent laisser tomber des objets que Bob l'éponge devra récupérer. Ils aideront votre héros dans d'autres batailles.